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中央情報局
命中注定的宿敵
阿寶．尼爾 與 馬沙．阿玆納布
一年戰爭
阿寶．尼爾出生於地球，其父是地球聯邦軍的技術軍官（後來的高達設計者）提姆．尼爾。後來提姆帶同阿寶離開地球，移居當時新建的衛星七號。
數年後，一年戰爭爆發，身為聯邦軍技術軍官的提姆．尼爾著手進行新型ＭＳ的開發，並在衛星七號的工場內完成。聯邦軍從賈布羅基地派來強襲登陸艦白色基地，準備接收剛完成的ＭＳ。可是，自護公國軍多爾茲．薩比中將靡下的馬沙．阿玆納布早已洞悉天機，對他們的行動知道得一清二楚。
馬沙知道白色基地的目的地是衛星七號，遂派出三台渣古潛入衛星七號偵察。偵查部隊發現了聯邦軍的新型ＭＳ，未等上級指示便自行開始破壞行動。當時剛好身在現場的阿寶發現附近有一台白色的機動戰士高達躺在運輸車上，忙亂之間登上高達，把兩台渣古擊毀。
比時，身為作戰指揮官的馬沙正在自護軍的姆賽巡洋艦之上，向白色基地發動突襲。白色基地艦長因而受傷，代替他執行艦長職務的是當時一位見習軍官布拉度．諾亞。
因為當時沒有足夠的人手擔任ＭＳ駕駛員，所以便就地取材，緊急徵召曾擊毀兩台渣古的阿寶入伍；成為高達的駕駛員。
及後，過半船員都是平民的白色基地在布拉度的指揮下以新人類部隊的名義立下不少功勳。
一方，馬沙因為未能殲滅白色基地、保護加曼上校不力而遭到下放，在印度認識了娜娜。馬沙認為娜娜具備成為新人類的潛質，決定與她一同返回宇宙。
雖然阿寶和娜娜在戰場上是敵人，但兩人的新人類體質令彼此的意識產生共鳴，使馬沙嫉妒非常。娜娜之死為阿寶、娜娜和馬沙之間的恩恩怨怨畫上休止符。
阿寶的觸覺和對機動戰士適應能力都非常優秀，在人類能力學方面得到很高的評價。馬沙不想後世人對新人類產生錯誤觀念，以為他們都是最好的駕駛員；所以決定親手殺死阿寶，以證明非新人類的能力也同樣厲害。
阿寶與馬沙之戰因馬沙之妹馬茜．瑪斯的介入而中斷。戰爭因自護公國內部分裂而告終，至於阿寶和馬沙則在沒有和解的情況之下分別離開戰場。
克里普斯戰爭
馬沙和自護殘存部隊一起逃往阿古捷斯，聯同哈瑪嘉重頭做起，企圖令自護再次復興。
阿寶由於背負著新人類的名份，被當時的聯邦政府以「新人類有可能謀反」為理由軟禁在地球。
雖然得到軍官的最高待遇，但同時被強迫在北美洲大陸內某舊世紀時代的核子基地作導遊。
馬沙藉詞打探地球圈的情況和軍事技術，離開阿古捷斯，返回地球。
與此同時，地球圈的公國軍殘黨討伐部隊，聯邦軍的泰坦斯正大力提倡地球至上主義，並不斷擴張勢力。
馬沙從非法途徑得到聯邦軍的軍籍之後，再以從阿古捷斯得到的軍事技術作見面體，化名為古華多羅．巴志拿，加入了反地球聯邦政府組織─奧干（ＡＥＵＧ＝Anti Earth United Government）
馬沙加入的奧干在背後得到阿拉巴瑪電子儀器社的大力支持，資源之豐富足可與泰坦斯抗衡。在克里普斯一號發生的搶奪試作型ＭＳ事件令泰坦斯與奧干之間的戰爭變得更加激烈。
另一個反地球聯邦組織卡拉巴從聯邦政府手中救出了一直被軟禁的阿寶，及後阿寶與奧干會合，並且重遇馬沙。馬沙與阿寶決定攜手合作，對抗掌握了聯邦軍大權的泰坦斯。
奧干的領導人布力克斯被泰坦斯暗殺一事曾一度令奧干陷於困境，後來布力克斯指定的接班人馬沙在達喀爾的聯邦會議上演說，把泰坦斯的惡行公諸於世，共公開表示自己就是自護．什姆．戴肯的兒子。這次行動令聯邦政府內部的泰坦斯和奧干的勢力關係逆轉，各個一直在旁觀察事態的殖民地及月面都市都乘機發動反抗泰坦斯的行動。原本掌握在聯邦軍手上的主導權，現已落入奧干的手上了。
阿寶希望馬沙運用自己的政治影響力重建聯邦政府，但馬沙以地球聯邦政府已經無藥可救而拒絕。
另外，透過跟哈瑪嘉及斯洛哥的戰鬥，馬沙初次親身體驗到地球圈是一個充滿了人類怨念的地方。
克里普斯戰爭結束之後，馬沙悄然離開聯邦政府，去為他滅絕地球人口的計劃作準備。至於阿寶則再次返回地球聯邦軍服役。
第二次新自護抗爭
馬沙佔領史威度．活特，對外發表新自護的復活宣言。為了把月神五號投向地球聯邦的拉薩總部，新自護的艦隊向著月神五號進發。
聯邦軍隆巴納艦隊趕赴月神五號阻止，隸屬隆巴納艦隊的阿寶駕駛新型ＭＳ零格斯參戰，但新自護的強化人基尼．戒司令他分身不暇，再加上馬沙的沙煞比中途參戰，月神五號最終仍然墜下拉薩。
當馬沙知道阿拉巴瑪建造n高達的時候，他決定透過阿拉巴瑪把新自護開發的賽可謬骨架技術提供給阿寶。馬沙希望以機動戰士駕駛員的身份與阿寶決一高下，所以他希望這是一場對等的較量。馬沙在洛狄理奧與聯邦政府達成協議，新自護會解除武裝，而聯邦軍則會交出阿古捷斯。此時，馬沙發覺聯邦軍特派副參謀長亞迪拉韋．巴拉亞的女兒姬斯擁有新人類的潛質，認為姬斯可以成為他的一件武器。對馬沙來說，姬斯那種在戰場上洞悉一切的能力，正是他最想得到的。
原本將會解除武裝到月神二號的新自護艦隊突然破壞協議，攻陷月神二號；並奪走存放在該處的核武器。與此同時，位於另一方的別動部隊亦成功奪得阿古捷斯。及後，阿古捷斯被裝上核推進引擎，開始向地球進發。
曾在克里普斯戰爭時與馬沙一同作戰的布拉度．諾亞趕往阿古捷斯，用盡一切方法攔截阿古捷斯。包括破壞推進器，改變其路線、以核彈將之炸毀及進行內部爆破。
一輪激戰後，雙方死傷枕藉。雖然布拉度終於成功把阿古捷斯爆破，但被炸成兩截的阿古捷斯後半部仍是向地球墜下。n高達與沙煞比之戰最於由n高達勝出，馬沙的逃生球被阿寶捕獲。阿寶駕駛著n高達，帶同逃生球內的馬沙飛到阿古捷斯，企圖改變它的方向。
一直在旁觀戰的積根及居勒．德根見狀亦一同加入阻止的行列。阿寶與馬沙的賽可謬骨架產生共振，令n高達身上發出光芒，包圍整個阿古捷斯，使它改變軌道，遠離地球。宇宙又再回復片刻的寧靜。
地球聯邦和（新）自護的戰爭到這裏可算是完了，而阿寶與馬沙十四年來的恩恩怨怨亦告終止。
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